MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 7006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010475	A	7	7	1373	1379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010475	AGT	2	6	1398	1403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010475	CAA	2	6	2363	2368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010475	ACA	2	6	2411	2416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010475	A	6	6	2440	2445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010475	ATT	2	6	2449	2454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010475	TCC	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010475	A	6	6	2499	2504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010475	TAA	2	6	3128	3133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010475	A	6	6	3132	3137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010475	ATT	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010475	TAT	2	6	5662	5667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010475	GGC	2	6	5681	5686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010475	GTC	2	6	6831	6836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010475	AGG	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010475	T	6	6	6899	6904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010475	AGG	2	6	6905	6910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010475	GAT	2	6	6922	6927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010475	T	6	6	6936	6941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010475	AAGA	2	8	7032	7039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010475	T	6	6	7616	7621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010475	AAT	2	6	7691	7696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010475	A	7	7	9631	9637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010475	ATTT	2	8	9645	9652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010475	GAAA	2	8	9654	9661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010475	T	6	6	9664	9669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010475	ATA	2	6	9693	9698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010475	TTG	2	6	9709	9714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010475	GAT	2	6	10503	10508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010475	GTG	2	6	10534	10539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010475	TTGC	2	8	11789	11796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010475	CTT	3	9	12184	12192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010475	GAA	2	6	12271	12276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010475	CTT	2	6	12284	12289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010475	CTG	2	6	12291	12296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010475	GTCGG	2	10	12629	12638	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010475	TCC	2	6	14804	14809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010475	AACT	2	8	20056	20063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010475	A	6	6	21003	21008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010475	TAA	2	6	21053	21058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010475	T	7	7	21102	21108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010475	ATC	2	6	24579	24584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010475	CCA	2	6	24631	24636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010475	TTAAAA	2	12	24638	24649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010475	A	6	6	24688	24693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010475	GAAA	2	8	24706	24713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010475	A	6	6	24711	24716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010475	GCC	2	6	24760	24765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010475	ATC	2	6	24788	24793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010475	GTT	2	6	26431	26436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010475	ATA	2	6	27162	27167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010475	A	6	6	28264	28269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010475	TTG	2	6	28270	28275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010475	GTA	2	6	28322	28327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010475	CCAAAG	2	12	28343	28354	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010475	AAG	3	9	28352	28360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010475	CTT	2	6	28857	28862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010475	A	6	6	28868	28873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010475	C	8	8	28906	28913	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_010475	CAAA	2	8	29038	29045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010475	AAC	2	6	29057	29062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010475	TCGC	2	8	29073	29080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010475	GCT	3	9	29084	29092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010475	TAA	2	6	29099	29104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010475	CT	3	6	29178	29183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010475	AGA	2	6	29272	29277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010475	CAG	2	6	29320	29325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010475	ACA	2	6	29362	29367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010475	GTTTT	2	10	29394	29403	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010475	CGT	2	6	30827	30832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010475	TTGA	2	8	30852	30859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010475	GAA	2	6	31767	31772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010475	A	6	6	31784	31789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010475	TCG	2	6	33445	33450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010475	TTA	2	6	33461	33466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010475	A	6	6	34554	34559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010475	AAGG	2	8	34624	34631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010475	T	6	6	35748	35753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010475	A	7	7	37606	37612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010475	GTA	2	6	37648	37653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010475	CTAC	2	8	37859	37866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010475	CCAG	2	8	37867	37874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010475	GGC	2	6	37918	37923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010475	GGC	2	6	37983	37988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010475	TCT	2	6	37989	37994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010475	A	7	7	38039	38045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010475	AAT	2	6	38093	38098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010475	CCT	2	6	39988	39993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010475	AAT	2	6	40013	40018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010475	GGTT	2	8	40057	40064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010475	AAT	2	6	40069	40074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010475	AG	3	6	45950	45955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010475	A	7	7	46029	46035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010475	GCA	2	6	46054	46059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010475	ATTT	2	8	46088	46095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010475	T	6	6	46093	46098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010475	TAA	2	6	46113	46118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010475	A	7	7	46128	46134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010475	T	6	6	46749	46754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010475	A	6	6	46790	46795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010475	TTG	2	6	49109	49114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010475	T	6	6	49231	49236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010475	ACA	2	6	49325	49330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010475	TAA	2	6	49461	49466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010475	TTG	2	6	49480	49485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010475	CCGTC	2	10	51228	51237	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_010475	TTG	2	6	51249	51254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010475	GTT	2	6	51275	51280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010475	CATCG	2	10	56316	56325	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_010475	ATT	2	6	56330	56335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010475	T	6	6	56334	56339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010475	ATC	2	6	56340	56345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010475	ATC	3	9	56364	56372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010475	TAC	2	6	59514	59519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010475	CAA	2	6	60280	60285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010475	ATAG	2	8	60664	60671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010475	ATT	2	6	60694	60699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010475	G	6	6	61237	61242	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010475	A	6	6	61273	61278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010475	G	6	6	61937	61942	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010475	T	7	7	63272	63278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010475	A	7	7	63315	63321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010475	CAGA	2	8	63328	63335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010475	TC	3	6	64323	64328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010475	TAA	2	6	64401	64406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010475	CAA	2	6	64419	64424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010475	T	6	6	64467	64472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010475	ACTT	2	8	64473	64480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010475	CAA	2	6	65744	65749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010475	GCG	2	6	65774	65779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010475	TG	3	6	65812	65817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010475	GCG	2	6	70749	70754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010475	CAT	2	6	70766	70771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010475	TAA	2	6	70795	70800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010475	T	6	6	70807	70812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010475	TCGT	2	8	70829	70836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010475	AAG	2	6	72346	72351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010475	TTGA	2	8	74142	74149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010475	TAG	2	6	76342	76347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010475	TAA	2	6	76851	76856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010475	TAC	2	6	76880	76885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010475	TAA	2	6	77240	77245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010475	TCTA	2	8	77248	77255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010475	CTGTA	2	10	77269	77278	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_010475	T	6	6	78147	78152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010475	TTGGG	2	10	78164	78173	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010475	CAC	2	6	78217	78222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_010475	A	6	6	78223	78228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_010475	ATT	2	6	130024	130029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_010475	GAA	2	6	195166	195171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_010475	CTT	2	6	204719	204724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_010475	ATC	2	6	215820	215825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_010475	AGA	2	6	215827	215832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_010475	TAA	2	6	215849	215854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_010475	A	7	7	215853	215859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_010475	TAA	2	6	215868	215873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_010475	A	6	6	215883	215888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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